Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
TRIM41Q8WV44 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC42.34■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
TRIM41Q8WV44 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
TRIM41Q8WV44 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
TRIM41Q8WV44 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TRIM41Q8WV44 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
TRIM41Q8WV44 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC42.05■■■■■ 4.32
TRIM41Q8WV44 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms