Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COG1Q8WTW3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
COG1Q8WTW3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COG1Q8WTW3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG1Q8WTW3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms