Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP33Q8TEY7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP33Q8TEY7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP33Q8TEY7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms