Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA94

ZNF563, Zinc finger protein 563, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF563Q8TA94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF563Q8TA94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF563Q8TA94 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF563Q8TA94 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF563Q8TA94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 328.6 ms