Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LINC00301Q8NCQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LINC00301Q8NCQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00301Q8NCQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00301Q8NCQ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms