Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAE3

LINC01555, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01555, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01555Q8NAE3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LINC01555Q8NAE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LINC01555Q8NAE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC01555Q8NAE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC01555Q8NAE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms