Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN12Q8IYM2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN12Q8IYM2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLFN12Q8IYM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLFN12Q8IYM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms