Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXK0

PHC2, Polyhomeotic-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC2Q8IXK0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHC2Q8IXK0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PHC2Q8IXK0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHC2Q8IXK0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHC2Q8IXK0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms