Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
WDR88Q6ZMY6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WDR88Q6ZMY6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms