Protein–RNA interactions for Protein: Q6VN20

RANBP10, Ran-binding protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP10Q6VN20 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RANBP10Q6VN20 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RANBP10Q6VN20 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RANBP10Q6VN20 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms