Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC171Q6TFL3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC171Q6TFL3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC171Q6TFL3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms