Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPRIN2Q6IMN6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPRIN2Q6IMN6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPRIN2Q6IMN6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPRIN2Q6IMN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms