Protein–RNA interactions for Protein: Q69YH5

CDCA2, Cell division cycle-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA2Q69YH5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDCA2Q69YH5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDCA2Q69YH5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDCA2Q69YH5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDCA2Q69YH5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDCA2Q69YH5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms