Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
E4F1Q66K89 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
E4F1Q66K89 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
E4F1Q66K89 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
E4F1Q66K89 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms