Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1orf140Q5VVS0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf140Q5VVS0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf140Q5VVS0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms