Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AGAP9Q5VTM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AGAP9Q5VTM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AGAP9Q5VTM2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGAP9Q5VTM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP9Q5VTM2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms