Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAB7

RIPPLY2, Protein ripply2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY2Q5TAB7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY2Q5TAB7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY2Q5TAB7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY2Q5TAB7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPPLY2Q5TAB7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms