Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMTC4Q5T4D3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMTC4Q5T4D3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMTC4Q5T4D3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMTC4Q5T4D3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms