Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D2

TREML2, Trem-like transcript 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML2Q5T2D2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TREML2Q5T2D2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TREML2Q5T2D2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TREML2Q5T2D2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TREML2Q5T2D2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms