Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR38Q5JTN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WDR38Q5JTN6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
WDR38Q5JTN6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms