Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
WDR44Q5JSH3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
WDR44Q5JSH3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR44Q5JSH3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms