Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLRC3Q5JS37 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLRC3Q5JS37 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NHLRC3Q5JS37 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms