Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PITRM1Q5JRX3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PITRM1Q5JRX3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PITRM1Q5JRX3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PITRM1Q5JRX3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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