Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRMT12Q53H54 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRMT12Q53H54 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRMT12Q53H54 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms