Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC44A4Q53GD3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC44A4Q53GD3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC44A4Q53GD3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC44A4Q53GD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms