Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFTN2Q52LD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFTN2Q52LD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFTN2Q52LD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms