Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRRK1Q38SD2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRK1Q38SD2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRK1Q38SD2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRRK1Q38SD2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.6 ms