Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.981e-6■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.161e-6■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.261e-6■■■■■ 55.4
SF3B4Q15427 A2M-202ENST00000404455 623 ntTSL 55.47□□□□□ -1.535e-25■■■■■ 55.2
SF3B4Q15427 F11-202ENST00000264692 1916 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.929e-17■■■■■ 55.2
SF3B4Q15427 F11-203ENST00000403665 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.959e-17■■■■■ 55.2
SF3B4Q15427 F11-204ENST00000452239 717 ntTSL 55.17□□□□□ -1.589e-17■■■■■ 55.2
SF3B4Q15427 UNK-201ENST00000586217 651 ntTSL 319.19■□□□□ 0.666e-11■■■■■ 55.1
SF3B4Q15427 ZNF500-206ENST00000589422 1831 ntTSL 1 (best)17.26■□□□□ 0.351e-14■■■■■ 55
SF3B4Q15427 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.331e-14■■■■■ 55
SF3B4Q15427 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.131e-14■■■■■ 55
SF3B4Q15427 CAD-207ENST00000475695 687 ntTSL 314.84□□□□□ -0.039e-11■■■■■ 55
SF3B4Q15427 STARD3-210ENST00000577248 571 ntTSL 415.79■□□□□ 0.121e-16■■■■■ 54.9
SF3B4Q15427 STARD3-222ENST00000583419 579 ntTSL 414.07□□□□□ -0.161e-16■■■■■ 54.9
SF3B4Q15427 RRP12-205ENST00000465394 652 ntTSL 515.19■□□□□ 0.024e-11■■■■■ 54.8
SF3B4Q15427 OPA1-213ENST00000475899 685 ntTSL 33.41□□□□□ -1.863e-10■■■■■ 54.8
SF3B4Q15427 PLEKHH3-209ENST00000592974 628 ntTSL 314.77□□□□□ -0.057e-11■■■■■ 54.7
SF3B4Q15427 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.42e-11■■■■■ 54.7
SF3B4Q15427 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.382e-11■■■■■ 54.7
SF3B4Q15427 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 54.7
SF3B4Q15427 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 54.7
SF3B4Q15427 CCT7-210ENST00000473786 811 ntTSL 58.86□□□□□ -0.992e-11■■■■■ 54.7
SF3B4Q15427 WIPI2-212ENST00000485854 773 ntTSL 319.38■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 54.6
SF3B4Q15427 WIPI2-214ENST00000496867 745 ntTSL 515.69■□□□□ 0.11e-7■■■■■ 54.6
SF3B4Q15427 WIPI2-208ENST00000475309 2558 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 54.6
SF3B4Q15427 ZDHHC7-205ENST00000566909 582 ntTSL 24.63□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 54.6
SF3B4Q15427 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.471e-9■■■■■ 54.5
SF3B4Q15427 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 54.5
SF3B4Q15427 LYN-203ENST00000520050 550 ntTSL 46.12□□□□□ -1.431e-9■■■■■ 54.5
SF3B4Q15427 MED24-226ENST00000580921 574 ntTSL 312.69□□□□□ -0.388e-7■■■■■ 54.5
SF3B4Q15427 ATPAF2-201ENST00000444058 685 ntTSL 317.19■□□□□ 0.341e-11■■■■■ 54.4
SF3B4Q15427 AC087163.3-201ENST00000624345 700 ntBASIC10.83□□□□□ -0.681e-11■■■■■ 54.4
SF3B4Q15427 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.715e-18■■■■■ 54.4
SF3B4Q15427 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.635e-18■■■■■ 54.4
SF3B4Q15427 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.575e-18■■■■■ 54.4
SF3B4Q15427 PTGES2-203ENST00000449878 803 ntTSL 522.21■■□□□ 1.155e-10■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 PTGES2-204ENST00000474124 873 ntTSL 520.94■□□□□ 0.945e-10■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 PTGES2-207ENST00000483625 898 ntTSL 520.39■□□□□ 0.851e-13■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 PTGES2-206ENST00000476748 699 ntTSL 215.64■□□□□ 0.091e-13■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 PTGES2-210ENST00000487063 638 ntTSL 313.88□□□□□ -0.195e-10■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 PTGES2-213ENST00000497109 684 ntTSL 513.68□□□□□ -0.221e-13■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 UROS-209ENST00000470483 777 ntTSL 213.37□□□□□ -0.276e-14■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 UROS-210ENST00000484541 857 ntTSL 312.63□□□□□ -0.396e-14■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 UROS-211ENST00000616800 441 ntTSL 53.23□□□□□ -1.896e-14■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 FDPS-215ENST00000490140 680 ntTSL 210.92□□□□□ -0.667e-20■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 FDPS-214ENST00000489324 475 ntTSL 28.88□□□□□ -0.997e-20■■■■■ 54.3
SF3B4Q15427 SNHG1-207ENST00000537965 578 ntTSL 54.94□□□□□ -1.627e-52■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 SNHG1-222ENST00000545308 646 ntTSL 23.77□□□□□ -1.817e-52■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 RPL5-205ENST00000497519 1210 ntTSL 28.59□□□□□ -1.033e-9■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 SMPD4-213ENST00000454468 3586 ntTSL 1 (best)11.08□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 SMPD4-205ENST00000431183 3614 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 SMPD4-206ENST00000433118 3335 ntTSL 510.05□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 SMPD4-201ENST00000351288 3661 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 SMPD4-203ENST00000412570 3601 ntTSL 28.32□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 54.2
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SF3B4Q15427 TIA1-202ENST00000361692 543 ntTSL 52.22□□□□□ -2.051e-11■■■■■ 54.2
SF3B4Q15427 PUM1-212ENST00000498627 422 ntTSL 27.22□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 54.1
SF3B4Q15427 UNC13D-213ENST00000590762 848 ntTSL 520.57■□□□□ 0.886e-9■■■■■ 54.1
SF3B4Q15427 UNC13D-205ENST00000586147 589 ntTSL 512.99□□□□□ -0.337e-9■■■■■ 54.1
SF3B4Q15427 UNC13D-210ENST00000587504 1050 ntTSL 512.46□□□□□ -0.416e-9■■■■■ 54.1
SF3B4Q15427 UNC13D-215ENST00000591563 4382 ntTSL 212.46□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 54.1
SF3B4Q15427 UNC13D-217ENST00000592386 930 ntTSL 58.98□□□□□ -0.976e-9■■■■■ 54.1
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SF3B4Q15427 EIF4A1-233ENST00000584784 818 ntTSL 58.81□□□□□ -14e-40■■■■■ 54
SF3B4Q15427 EIF4A1-209ENST00000578495 916 ntTSL 58.41□□□□□ -1.064e-40■■■■■ 54
SF3B4Q15427 EIF4A1-211ENST00000578754 547 ntTSL 44.87□□□□□ -1.634e-40■■■■■ 54
SF3B4Q15427 GLB1L2-204ENST00000533324 582 ntTSL 312□□□□□ -0.499e-11■■■■■ 54
SF3B4Q15427 KRT18-204ENST00000548015 928 ntTSL 29.97□□□□□ -0.819e-11■■■■■ 54
SF3B4Q15427 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.364e-44■■■■■ 54
SF3B4Q15427 SNHG25-201ENST00000580828 106 ntTSL 211.12□□□□□ -0.634e-44■■■■■ 54
SF3B4Q15427 KIF20A-204ENST00000504621 810 ntTSL 38.33□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 54
SF3B4Q15427 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-18■■■■■ 53.7
SF3B4Q15427 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 513.63□□□□□ -0.232e-18■■■■■ 53.7
SF3B4Q15427 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 48.83□□□□□ -12e-18■■■■■ 53.7
SF3B4Q15427 SFI1-206ENST00000417682 1817 ntTSL 515.03■□□□□ -01e-31■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 SFI1-228ENST00000524296 2108 ntTSL 514.92□□□□□ -0.021e-31■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 SFI1-217ENST00000466991 545 ntTSL 514.3□□□□□ -0.121e-31■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 SFI1-226ENST00000491973 580 ntTSL 413.51□□□□□ -0.251e-31■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 310.54□□□□□ -0.724e-13■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 59.21□□□□□ -0.944e-13■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.23e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.283e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 U2SURP-211ENST00000488497 3557 ntTSL 1 (best)6.11□□□□□ -1.433e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 SENP5-203ENST00000434433 622 ntTSL 34.87□□□□□ -1.633e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.643e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 U2SURP-207ENST00000472373 1182 ntTSL 24.3□□□□□ -1.723e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 U2SURP-212ENST00000488587 866 ntTSL 34.28□□□□□ -1.723e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.763e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 U2SURP-209ENST00000480029 2855 ntTSL 22.63□□□□□ -1.993e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 U2SURP-203ENST00000463563 4364 ntTSL 22.51□□□□□ -2.013e-16■■■■■ 53.6
SF3B4Q15427 DVL1-206ENST00000632445 785 ntTSL 522.86■■□□□ 1.252e-8■■■■■ 53.5
SF3B4Q15427 SNHG17-207ENST00000449469 2138 ntTSL 215.97■□□□□ 0.153e-15■■■■■ 53.5
SF3B4Q15427 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.093e-15■■■■■ 53.5
SF3B4Q15427 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.053e-15■■■■■ 53.5
SF3B4Q15427 SNHG17-202ENST00000414142 2102 ntTSL 212.09□□□□□ -0.473e-15■■■■■ 53.5
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