RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540468.5

CCT7-216, Transcript of chaperonin containing TCP1 subunit 7, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCT7, Length 1,674 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT7-216ENST00000540468 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.42■■■■□ 3.58
CCT7-216ENST00000540468 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.02■■■□□ 2.88
CCT7-216ENST00000540468 ABCC9O60706 1549 aa31.9■■■□□ 2.7
CCT7-216ENST00000540468 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CCT7-216ENST00000540468 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.06■■■□□ 2.56
CCT7-216ENST00000540468 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.93■■■□□ 2.54
CCT7-216ENST00000540468 NACADO15069 1562 aa30.9■■■□□ 2.54
CCT7-216ENST00000540468 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.85■■■□□ 2.53
CCT7-216ENST00000540468 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.83■■■□□ 2.53
CCT7-216ENST00000540468 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.28■■■□□ 2.44
CCT7-216ENST00000540468 SCRIBQ14160 1630 aa30.24■■■□□ 2.43
CCT7-216ENST00000540468 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.98■■■□□ 2.39
CCT7-216ENST00000540468 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.93■■■□□ 2.38
CCT7-216ENST00000540468 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.386e-6■■□□□ 12.8
CCT7-216ENST00000540468 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.16■■■□□ 2.26
CCT7-216ENST00000540468 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CCT7-216ENST00000540468 SMARCA4P51532 1647 aa28.95■■■□□ 2.22
CCT7-216ENST00000540468 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CCT7-216ENST00000540468 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.9■■■□□ 2.22
CCT7-216ENST00000540468 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.89■■■□□ 2.22
CCT7-216ENST00000540468 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.88■■■□□ 2.21
CCT7-216ENST00000540468 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CCT7-216ENST00000540468 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.65■■■□□ 2.18
CCT7-216ENST00000540468 WIZO95785 1651 aa28.63■■■□□ 2.17
CCT7-216ENST00000540468 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.62■■■□□ 2.17
CCT7-216ENST00000540468 SMARCA2P51531 1590 aa28.59■■■□□ 2.17
CCT7-216ENST00000540468 NCAPD3P42695 1498 aa28.53■■■□□ 2.16
CCT7-216ENST00000540468 HMGXB3Q12766 1538 aa28.43■■■□□ 2.14
CCT7-216ENST00000540468 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
CCT7-216ENST00000540468 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CCT7-216ENST00000540468 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CCT7-216ENST00000540468 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.98■■■□□ 2.07
CCT7-216ENST00000540468 NESP48681 1621 aa27.8■■■□□ 2.04
CCT7-216ENST00000540468 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.73■■■□□ 2.03
CCT7-216ENST00000540468 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.69■■■□□ 2.02
CCT7-216ENST00000540468 CFTRP13569 1480 aa27.67■■■□□ 2.02
CCT7-216ENST00000540468 PRDM2Q13029 1718 aa27.55■■■□□ 2
CCT7-216ENST00000540468 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.48■■□□□ 1.99
CCT7-216ENST00000540468 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.45■■□□□ 1.99
CCT7-216ENST00000540468 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.42■■□□□ 1.98
CCT7-216ENST00000540468 ERCC6Q03468 1493 aa27.39■■□□□ 1.98
CCT7-216ENST00000540468 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.33■■□□□ 1.96
CCT7-216ENST00000540468 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.31■■□□□ 1.96
CCT7-216ENST00000540468 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CCT7-216ENST00000540468 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.19■■□□□ 1.94
CCT7-216ENST00000540468 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CCT7-216ENST00000540468 ABCC8Q09428 1581 aa27.16■■□□□ 1.94
CCT7-216ENST00000540468 WDR62O43379 1518 aa27.1■■□□□ 1.93
CCT7-216ENST00000540468 CUX1P39880 1505 aa27.07■■□□□ 1.92
CCT7-216ENST00000540468 TOPBP1Q92547 1522 aa27.06■■□□□ 1.92
CCT7-216ENST00000540468 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.05■■□□□ 1.92
CCT7-216ENST00000540468 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.02■■□□□ 1.92
CCT7-216ENST00000540468 SYNJ1O43426 1573 aa27.01■■□□□ 1.91
CCT7-216ENST00000540468 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.94■■□□□ 1.9
CCT7-216ENST00000540468 TOP2BQ02880 1626 aa26.94■■□□□ 1.9
CCT7-216ENST00000540468 CUX2O14529 1486 aa26.9■■□□□ 1.9
CCT7-216ENST00000540468 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.88■■□□□ 1.89
CCT7-216ENST00000540468 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CCT7-216ENST00000540468 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.78■■□□□ 1.88
CCT7-216ENST00000540468 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CCT7-216ENST00000540468 SOGA1O94964 1423 aa26.73■■□□□ 1.87
CCT7-216ENST00000540468 IFT140Q96RY7 1462 aa26.72■■□□□ 1.87
CCT7-216ENST00000540468 TRIM41Q8WV44 630 aa26.71■■□□□ 1.87
CCT7-216ENST00000540468 WDR97A6NE52 1622 aa26.66■■□□□ 1.86
CCT7-216ENST00000540468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CCT7-216ENST00000540468 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.61■■□□□ 1.85
CCT7-216ENST00000540468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CCT7-216ENST00000540468 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.848e-8■■■■■ 42.1
CCT7-216ENST00000540468 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CCT7-216ENST00000540468 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.5■■□□□ 1.83
CCT7-216ENST00000540468 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.44■■□□□ 1.82
CCT7-216ENST00000540468 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.44■■□□□ 1.82
CCT7-216ENST00000540468 PBRM1Q86U86 1689 aa26.4■■□□□ 1.82
CCT7-216ENST00000540468 KIF27Q86VH2 1401 aa26.39■■□□□ 1.82
CCT7-216ENST00000540468 GRIN2BQ13224 1484 aa26.35■■□□□ 1.81
CCT7-216ENST00000540468 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.29■■□□□ 1.8
CCT7-216ENST00000540468 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.28■■□□□ 1.8
CCT7-216ENST00000540468 IGF1RP08069 1367 aa26.27■■□□□ 1.8
CCT7-216ENST00000540468 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.25■■□□□ 1.79
CCT7-216ENST00000540468 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CCT7-216ENST00000540468 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CCT7-216ENST00000540468 ADAMTS12P58397 1594 aa26.2■■□□□ 1.78
CCT7-216ENST00000540468 EEA1Q15075 1411 aa26.18■■□□□ 1.78
CCT7-216ENST00000540468 CHD1O14646 1710 aa26.15■■□□□ 1.78
CCT7-216ENST00000540468 CUL7Q14999 1698 aa26.15■■□□□ 1.78
CCT7-216ENST00000540468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.13■■□□□ 1.77
CCT7-216ENST00000540468 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.13■■□□□ 1.77
CCT7-216ENST00000540468 SYNJ2O15056 1496 aa26.12■■□□□ 1.77
CCT7-216ENST00000540468 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.11■■□□□ 1.77
CCT7-216ENST00000540468 FBLN2P98095 1184 aa26.09■■□□□ 1.77
CCT7-216ENST00000540468 PRXQ9BXM0 1461 aa26.06■■□□□ 1.76
CCT7-216ENST00000540468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CCT7-216ENST00000540468 GRIN2AQ12879 1464 aa26.04■■□□□ 1.76
CCT7-216ENST00000540468 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26■■□□□ 1.75
CCT7-216ENST00000540468 KIF21BO75037 1637 aa25.95■■□□□ 1.74
CCT7-216ENST00000540468 CEP170Q5SW79 1584 aa25.94■■□□□ 1.74
CCT7-216ENST00000540468 NUP160Q12769 1436 aa25.9■■□□□ 1.74
CCT7-216ENST00000540468 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.9■■□□□ 1.74
CCT7-216ENST00000540468 OSCARQ8IYS5 282 aa25.88■■□□□ 1.73
CCT7-216ENST00000540468 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.83■■□□□ 1.72
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