Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SYVN1-212ENST00000530451 656 ntTSL 521.31■■□□□ 13e-7■■■■■ 40.6
PCBP1Q15365 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 11e-323■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 HBA1-203ENST00000472694 674 ntTSL 1 (best)19.68■□□□□ 0.741e-323■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.641e-323■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.341e-9■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)18.9■□□□□ 0.627e-8■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 516.74■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 515.89■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.137e-8■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 TCF25-210ENST00000563484 468 ntTSL 212.14□□□□□ -0.474e-10■■■■■ 40.5
PCBP1Q15365 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.565e-11■■■■■ 40.4
PCBP1Q15365 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 40.4
PCBP1Q15365 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.293e-15■■■■■ 40.3
PCBP1Q15365 H2AFX-201ENST00000375167 1373 ntTSL 219.38■□□□□ 0.693e-15■■■■■ 40.3
PCBP1Q15365 SEZ6L2-203ENST00000350527 3173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.557e-7■■■■■ 40.3
PCBP1Q15365 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 40.3
PCBP1Q15365 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.399e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.68■■□□□ 1.389e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.356e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 ATXN7L2-204ENST00000463678 3022 ntTSL 522.12■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.1■■□□□ 1.139e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 JUP-204ENST00000420370 915 ntTSL 321.84■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 JUP-212ENST00000591690 583 ntTSL 320.84■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.919e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.859e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 520.02■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 JUP-208ENST00000449889 1069 ntTSL 319.28■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.95■□□□□ 0.39e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 JUP-206ENST00000437187 1029 ntTSL 316.87■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 JUP-205ENST00000424457 949 ntTSL 316.87■□□□□ 0.299e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 C7orf50-206ENST00000465681 2621 ntTSL 1 (best)16.64■□□□□ 0.259e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 40.2
PCBP1Q15365 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.677e-7■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 NCLN-203ENST00000587740 1210 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.355e-7■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 NCLN-208ENST00000592737 2735 ntTSL 316.79■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 NCLN-206ENST00000591062 460 ntTSL 516.13■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 15e-8■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-8■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 CD276-210ENST00000560928 2181 ntTSL 215.86■□□□□ 0.132e-14■■■■■ 40.1
PCBP1Q15365 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.294e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 TCEA2-201ENST00000339217 953 ntTSL 329.22■■■□□ 2.274e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.244e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 TCEA2-216ENST00000487164 1060 ntTSL 1 (best)26.74■■□□□ 1.874e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.598e-8■■■■■ 40
PCBP1Q15365 YIPF2-206ENST00000588347 753 ntTSL 224.7■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.418e-8■■■■■ 40
PCBP1Q15365 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.358e-8■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-224ENST00000514527 660 ntTSL 321.81■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-215ENST00000510319 557 ntTSL 421.65■■□□□ 1.064e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 BCL3-209ENST00000487394 603 ntTSL 321.27■■□□□ 14e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 GPSM3-208ENST00000472768 1417 ntTSL 220.34■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.844e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 YIPF2-207ENST00000588962 788 ntTSL 219.9■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 YIPF2-202ENST00000585858 656 ntTSL 319.9■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 319.61■□□□□ 0.734e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 NAPA-202ENST00000593761 891 ntTSL 518.64■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 317.33■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-225ENST00000514873 542 ntTSL 416.79■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 NAPA-219ENST00000601208 989 ntTSL 516.6■□□□□ 0.254e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 NAPA-221ENST00000602082 894 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.144e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-222ENST00000513974 548 ntTSL 414.81□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.084e-13■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-221ENST00000488111 2381 ntTSL 1 (best)14.5□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.138e-8■■■■■ 40
PCBP1Q15365 TCEA2-214ENST00000476113 421 ntTSL 213.95□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.214e-13■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-210ENST00000413197 2442 ntTSL 213.69□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-209ENST00000412922 1935 ntTSL 513.6□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 NAPA-204ENST00000593905 548 ntTSL 313.4□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-226ENST00000514931 550 ntTSL 213.04□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-213ENST00000449174 668 ntTSL 313.03□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 COPS7B-217ENST00000461350 3299 ntTSL 211.7□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 GPSM3-210ENST00000619085 1177 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-207ENST00000505185 225 ntTSL 210.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-206ENST00000504052 630 ntTSL 410.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-213ENST00000508777 1387 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 NAPA-206ENST00000594155 416 ntTSL 59.07□□□□□ -0.964e-7■■■■■ 40
PCBP1Q15365 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 40
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