RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317508.10

PRSS8-201, Transcript of serine protease 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRSS8, Length 1,872 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS8-201ENST00000317508 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.55■■■□□ 2.64
PRSS8-201ENST00000317508 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.51■■■□□ 2
PRSS8-201ENST00000317508 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PRSS8-201ENST00000317508 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.37■■□□□ 1.81
PRSS8-201ENST00000317508 ABCC9O60706 1549 aa26.25■■□□□ 1.79
PRSS8-201ENST00000317508 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.21■■□□□ 1.79
PRSS8-201ENST00000317508 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.07■■□□□ 1.76
PRSS8-201ENST00000317508 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PRSS8-201ENST00000317508 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.83■■□□□ 1.73
PRSS8-201ENST00000317508 NACADO15069 1562 aa25.71■■□□□ 1.71
PRSS8-201ENST00000317508 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.53■■□□□ 1.68
PRSS8-201ENST00000317508 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.33■■□□□ 1.65
PRSS8-201ENST00000317508 SCRIBQ14160 1630 aa25.32■■□□□ 1.64
PRSS8-201ENST00000317508 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.92■■□□□ 1.58
PRSS8-201ENST00000317508 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
PRSS8-201ENST00000317508 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
PRSS8-201ENST00000317508 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.75■■□□□ 1.55
PRSS8-201ENST00000317508 HRCP23327 699 aa24.55■■□□□ 1.52
PRSS8-201ENST00000317508 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.54■■□□□ 1.52
PRSS8-201ENST00000317508 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.37■■□□□ 1.49
PRSS8-201ENST00000317508 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.37■■□□□ 1.49
PRSS8-201ENST00000317508 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PRSS8-201ENST00000317508 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.36■■□□□ 1.49
PRSS8-201ENST00000317508 TRIM41Q8WV44 630 aa24.26■■□□□ 1.47
PRSS8-201ENST00000317508 SMARCA4P51532 1647 aa24.25■■□□□ 1.47
PRSS8-201ENST00000317508 WIZO95785 1651 aa24.24■■□□□ 1.47
PRSS8-201ENST00000317508 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PRSS8-201ENST00000317508 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PRSS8-201ENST00000317508 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PRSS8-201ENST00000317508 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.97■■□□□ 1.43
PRSS8-201ENST00000317508 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.94■■□□□ 1.42
PRSS8-201ENST00000317508 SMARCA2P51531 1590 aa23.91■■□□□ 1.42
PRSS8-201ENST00000317508 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
PRSS8-201ENST00000317508 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
PRSS8-201ENST00000317508 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.77■■□□□ 1.4
PRSS8-201ENST00000317508 NCAPD3P42695 1498 aa23.77■■□□□ 1.4
PRSS8-201ENST00000317508 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PRSS8-201ENST00000317508 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PRSS8-201ENST00000317508 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.71■■□□□ 1.39
PRSS8-201ENST00000317508 HMGXB3Q12766 1538 aa23.68■■□□□ 1.38
PRSS8-201ENST00000317508 ABCC8Q09428 1581 aa23.6■■□□□ 1.37
PRSS8-201ENST00000317508 EEA1Q15075 1411 aa23.58■■□□□ 1.36
PRSS8-201ENST00000317508 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PRSS8-201ENST00000317508 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.42■■□□□ 1.34
PRSS8-201ENST00000317508 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.4■■□□□ 1.34
PRSS8-201ENST00000317508 SOGA1O94964 1423 aa23.36■■□□□ 1.33
PRSS8-201ENST00000317508 CEP162Q5TB80 1403 aa23.35■■□□□ 1.33
PRSS8-201ENST00000317508 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.33■■□□□ 1.33
PRSS8-201ENST00000317508 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.28■■□□□ 1.32
PRSS8-201ENST00000317508 GOLGA3Q08378 1498 aa23.28■■□□□ 1.32
PRSS8-201ENST00000317508 KIF21BO75037 1637 aa23.23■■□□□ 1.31
PRSS8-201ENST00000317508 SYNJ1O43426 1573 aa23.21■■□□□ 1.31
PRSS8-201ENST00000317508 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.21■■□□□ 1.31
PRSS8-201ENST00000317508 CFTRP13569 1480 aa23.19■■□□□ 1.3
PRSS8-201ENST00000317508 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.17■■□□□ 1.3
PRSS8-201ENST00000317508 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.17■■□□□ 1.3
PRSS8-201ENST00000317508 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PRSS8-201ENST00000317508 TOP2BQ02880 1626 aa23.05■■□□□ 1.28
PRSS8-201ENST00000317508 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.03■■□□□ 1.28
PRSS8-201ENST00000317508 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PRSS8-201ENST00000317508 NESP48681 1621 aa22.98■■□□□ 1.27
PRSS8-201ENST00000317508 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.95■■□□□ 1.27
PRSS8-201ENST00000317508 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PRSS8-201ENST00000317508 PRDM2Q13029 1718 aa22.93■■□□□ 1.26
PRSS8-201ENST00000317508 CLIP1P30622 1438 aa22.93■■□□□ 1.26
PRSS8-201ENST00000317508 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.89■■□□□ 1.25
PRSS8-201ENST00000317508 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.89■■□□□ 1.25
PRSS8-201ENST00000317508 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.88■■□□□ 1.25
PRSS8-201ENST00000317508 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.85■■□□□ 1.25
PRSS8-201ENST00000317508 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.83■■□□□ 1.25
PRSS8-201ENST00000317508 CUX1P39880 1505 aa22.79■■□□□ 1.24
PRSS8-201ENST00000317508 PRXQ9BXM0 1461 aa22.77■■□□□ 1.24
PRSS8-201ENST00000317508 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PRSS8-201ENST00000317508 KIF27Q86VH2 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
PRSS8-201ENST00000317508 APLP2Q06481 763 aa22.64■■□□□ 1.22
PRSS8-201ENST00000317508 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.64■■□□□ 1.21
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PRSS8-201ENST00000317508 TOPBP1Q92547 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
PRSS8-201ENST00000317508 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PRSS8-201ENST00000317508 ARAP1Q96P48 1450 aa22.59■■□□□ 1.21
PRSS8-201ENST00000317508 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.58■■□□□ 1.2
PRSS8-201ENST00000317508 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PRSS8-201ENST00000317508 ERCC6Q03468 1493 aa22.53■■□□□ 1.2
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PRSS8-201ENST00000317508 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PRSS8-201ENST00000317508 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PRSS8-201ENST00000317508 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PRSS8-201ENST00000317508 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PRSS8-201ENST00000317508 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.43■■□□□ 1.18
PRSS8-201ENST00000317508 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.42■■□□□ 1.18
PRSS8-201ENST00000317508 CUX2O14529 1486 aa22.42■■□□□ 1.18
PRSS8-201ENST00000317508 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
PRSS8-201ENST00000317508 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PRSS8-201ENST00000317508 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.38■■□□□ 1.17
PRSS8-201ENST00000317508 WDR62O43379 1518 aa22.38■■□□□ 1.17
PRSS8-201ENST00000317508 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.37■■□□□ 1.17
PRSS8-201ENST00000317508 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
PRSS8-201ENST00000317508 MAP3K1Q13233 1512 aa22.35■■□□□ 1.17
PRSS8-201ENST00000317508 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PRSS8-201ENST00000317508 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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