RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449889.5

JUP-208, Transcript of junction plakoglobin, humanhuman

TSL 3

Gene JUP, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JUP-208ENST00000449889 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.08■■■■■ 4.49
JUP-208ENST00000449889 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.62■■■■□ 3.77
JUP-208ENST00000449889 ABCC9O60706 1549 aa38.39■■■■□ 3.74
JUP-208ENST00000449889 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.68■■■■□ 3.46
JUP-208ENST00000449889 NACADO15069 1562 aa36.48■■■■□ 3.43
JUP-208ENST00000449889 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.25■■■■□ 3.39
JUP-208ENST00000449889 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.06■■■■□ 3.36
JUP-208ENST00000449889 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.83■■■■□ 3.33
JUP-208ENST00000449889 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.78■■■■□ 3.32
JUP-208ENST00000449889 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.75■■■■□ 3.31
JUP-208ENST00000449889 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
JUP-208ENST00000449889 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.64■■■■□ 3.3
JUP-208ENST00000449889 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.55■■■■□ 3.28
JUP-208ENST00000449889 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.2■■■■□ 3.23
JUP-208ENST00000449889 SCRIBQ14160 1630 aa35.14■■■■□ 3.22
JUP-208ENST00000449889 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.71■■■■□ 3.15
JUP-208ENST00000449889 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
JUP-208ENST00000449889 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.6■■■■□ 3.13
JUP-208ENST00000449889 NCAPD3P42695 1498 aa33.66■■■□□ 2.98
JUP-208ENST00000449889 SMARCA4P51532 1647 aa33.57■■■□□ 2.96
JUP-208ENST00000449889 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.56■■■□□ 2.96
JUP-208ENST00000449889 SMARCA2P51531 1590 aa33.51■■■□□ 2.96
JUP-208ENST00000449889 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
JUP-208ENST00000449889 HMGXB3Q12766 1538 aa33.43■■■□□ 2.94
JUP-208ENST00000449889 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.26■■■□□ 2.92
JUP-208ENST00000449889 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.25■■■□□ 2.91
JUP-208ENST00000449889 ERCC6Q03468 1493 aa33.18■■■□□ 2.9
JUP-208ENST00000449889 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.17■■■□□ 2.9
JUP-208ENST00000449889 CUX2O14529 1486 aa33.09■■■□□ 2.89
JUP-208ENST00000449889 NESP48681 1621 aa33.01■■■□□ 2.87
JUP-208ENST00000449889 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.88■■■□□ 2.85
JUP-208ENST00000449889 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.85■■■□□ 2.85
JUP-208ENST00000449889 WIZO95785 1651 aa32.77■■■□□ 2.84
JUP-208ENST00000449889 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.69■■■□□ 2.82
JUP-208ENST00000449889 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
JUP-208ENST00000449889 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.64■■■□□ 2.82
JUP-208ENST00000449889 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.61■■■□□ 2.81
JUP-208ENST00000449889 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
JUP-208ENST00000449889 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
JUP-208ENST00000449889 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.38■■■□□ 2.77
JUP-208ENST00000449889 CFTRP13569 1480 aa32.3■■■□□ 2.76
JUP-208ENST00000449889 WDR62O43379 1518 aa32.3■■■□□ 2.76
JUP-208ENST00000449889 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.29■■■□□ 2.76
JUP-208ENST00000449889 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.26■■■□□ 2.75
JUP-208ENST00000449889 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.02■■■□□ 2.72
JUP-208ENST00000449889 PRDM2Q13029 1718 aa31.99■■■□□ 2.71
JUP-208ENST00000449889 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
JUP-208ENST00000449889 TOPBP1Q92547 1522 aa31.66■■■□□ 2.66
JUP-208ENST00000449889 ABCC8Q09428 1581 aa31.66■■■□□ 2.66
JUP-208ENST00000449889 IFT140Q96RY7 1462 aa31.65■■■□□ 2.66
JUP-208ENST00000449889 OSCARQ8IYS5 282 aa31.59■■■□□ 2.65
JUP-208ENST00000449889 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.57■■■□□ 2.64
JUP-208ENST00000449889 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
JUP-208ENST00000449889 TRIM41Q8WV44 630 aa31.44■■■□□ 2.62
JUP-208ENST00000449889 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.61
JUP-208ENST00000449889 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.36■■■□□ 2.61
JUP-208ENST00000449889 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
JUP-208ENST00000449889 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.62e-7■■■■□ 24.7
JUP-208ENST00000449889 SOGA1O94964 1423 aa31.22■■■□□ 2.59
JUP-208ENST00000449889 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
JUP-208ENST00000449889 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.21■■■□□ 2.59
JUP-208ENST00000449889 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.17■■■□□ 2.58
JUP-208ENST00000449889 CUX1P39880 1505 aa31.16■■■□□ 2.58
JUP-208ENST00000449889 WDR97A6NE52 1622 aa31.13■■■□□ 2.57
JUP-208ENST00000449889 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
JUP-208ENST00000449889 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
JUP-208ENST00000449889 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.13■■■□□ 2.57
JUP-208ENST00000449889 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
JUP-208ENST00000449889 CHD1O14646 1710 aa31.1■■■□□ 2.57
JUP-208ENST00000449889 ARHGEF11O15085 1522 aa31.06■■■□□ 2.56
JUP-208ENST00000449889 FBLN2P98095 1184 aa31.04■■■□□ 2.56
JUP-208ENST00000449889 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.97■■■□□ 2.55
JUP-208ENST00000449889 GRIN2BQ13224 1484 aa30.95■■■□□ 2.54
JUP-208ENST00000449889 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
JUP-208ENST00000449889 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
JUP-208ENST00000449889 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.85■■■□□ 2.53
JUP-208ENST00000449889 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.84■■■□□ 2.53
JUP-208ENST00000449889 SYNJ2O15056 1496 aa30.82■■■□□ 2.52
JUP-208ENST00000449889 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.81■■■□□ 2.52
JUP-208ENST00000449889 SYNJ1O43426 1573 aa30.8■■■□□ 2.52
JUP-208ENST00000449889 PBRM1Q86U86 1689 aa30.8■■■□□ 2.52
JUP-208ENST00000449889 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.78■■■□□ 2.52
JUP-208ENST00000449889 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.78■■■□□ 2.52
JUP-208ENST00000449889 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.77■■■□□ 2.523e-6■■■■■ 43.9
JUP-208ENST00000449889 ARAP1Q96P48 1450 aa30.76■■■□□ 2.52
JUP-208ENST00000449889 TOP2BQ02880 1626 aa30.73■■■□□ 2.51
JUP-208ENST00000449889 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.73■■■□□ 2.51
JUP-208ENST00000449889 GRIN2AQ12879 1464 aa30.53■■■□□ 2.48
JUP-208ENST00000449889 ADAMTS12P58397 1594 aa30.53■■■□□ 2.48
JUP-208ENST00000449889 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.47■■■□□ 2.47
JUP-208ENST00000449889 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.47■■■□□ 2.47
JUP-208ENST00000449889 NUP160Q12769 1436 aa30.43■■■□□ 2.46
JUP-208ENST00000449889 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
JUP-208ENST00000449889 CEP170Q5SW79 1584 aa30.39■■■□□ 2.46
JUP-208ENST00000449889 SHROOM2Q13796 1616 aa30.27■■■□□ 2.44
JUP-208ENST00000449889 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.26■■■□□ 2.43
JUP-208ENST00000449889 KIF27Q86VH2 1401 aa30.15■■■□□ 2.42
JUP-208ENST00000449889 JPH4Q96JJ6 628 aa30.11■■■□□ 2.41
JUP-208ENST00000449889 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
JUP-208ENST00000449889 IGF1RP08069 1367 aa30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms