Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ODF1Q14990 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ODF1Q14990 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ODF1Q14990 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms