Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBX1Q14549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBX1Q14549 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GBX1Q14549 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GBX1Q14549 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
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