Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERCC8Q13216 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERCC8Q13216 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERCC8Q13216 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERCC8Q13216 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERCC8Q13216 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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