Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACACAQ13085 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACACAQ13085 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACACAQ13085 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACACAQ13085 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACACAQ13085 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACACAQ13085 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ACACAQ13085 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACACAQ13085 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACACAQ13085 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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