Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRJQ12913 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PTPRJQ12913 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PTPRJQ12913 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRJQ12913 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRJQ12913 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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