Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TFCP2Q12800 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TFCP2Q12800 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TFCP2Q12800 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TFCP2Q12800 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
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