Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
APOBRQ0VD83 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
APOBRQ0VD83 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
APOBRQ0VD83 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
APOBRQ0VD83 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOBRQ0VD83 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms