Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDE4DQ08499 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDE4DQ08499 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDE4DQ08499 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDE4DQ08499 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms