Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TFF3Q07654 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFF3Q07654 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFF3Q07654 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFF3Q07654 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms