Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SOX4Q06945 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SOX4Q06945 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SOX4Q06945 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SOX4Q06945 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms