Protein–RNA interactions for Protein: Q06830

PRDX1, Peroxiredoxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX1Q06830 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDX1Q06830 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDX1Q06830 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDX1Q06830 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms