Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2C1P98194 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP2C1P98194 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2C1P98194 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2C1P98194 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms