Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELNP78509 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELNP78509 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RELNP78509 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELNP78509 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RELNP78509 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RELNP78509 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELNP78509 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELNP78509 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RELNP78509 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELNP78509 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELNP78509 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELNP78509 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELNP78509 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RELNP78509 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RELNP78509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RELNP78509 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RELNP78509 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RELNP78509 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RELNP78509 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RELNP78509 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELNP78509 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RELNP78509 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RELNP78509 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELNP78509 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELNP78509 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELNP78509 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RELNP78509 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELNP78509 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RELNP78509 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELNP78509 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELNP78509 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RELNP78509 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RELNP78509 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RELNP78509 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELNP78509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELNP78509 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RELNP78509 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RELNP78509 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RELNP78509 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RELNP78509 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELNP78509 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELNP78509 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELNP78509 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RELNP78509 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELNP78509 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RELNP78509 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELNP78509 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RELNP78509 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RELNP78509 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RELNP78509 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELNP78509 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELNP78509 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RELNP78509 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RELNP78509 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RELNP78509 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms