Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPL7AP62424 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL7AP62424 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPL7AP62424 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPL7AP62424 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPL7AP62424 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPL7AP62424 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms