Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNRPD2P62316 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNRPD2P62316 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SNRPD2P62316 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms