Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB10P61026 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB10P61026 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB10P61026 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RAB10P61026 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB10P61026 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RAB10P61026 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB10P61026 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB10P61026 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB10P61026 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RAB10P61026 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB10P61026 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB10P61026 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB10P61026 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB10P61026 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB10P61026 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB10P61026 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB10P61026 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB10P61026 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB10P61026 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB10P61026 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB10P61026 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB10P61026 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB10P61026 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB10P61026 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB10P61026 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB10P61026 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB10P61026 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB10P61026 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB10P61026 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB10P61026 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB10P61026 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB10P61026 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB10P61026 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB10P61026 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB10P61026 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB10P61026 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB10P61026 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB10P61026 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB10P61026 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB10P61026 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB10P61026 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB10P61026 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB10P61026 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB10P61026 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB10P61026 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB10P61026 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB10P61026 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB10P61026 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB10P61026 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB10P61026 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB10P61026 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB10P61026 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB10P61026 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB10P61026 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB10P61026 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB10P61026 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB10P61026 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB10P61026 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB10P61026 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms