Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPS1P60891 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPS1P60891 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms