Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RRADP55042 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RRADP55042 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRADP55042 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRADP55042 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRADP55042 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RRADP55042 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RRADP55042 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRADP55042 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRADP55042 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRADP55042 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RRADP55042 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RRADP55042 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRADP55042 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRADP55042 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRADP55042 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRADP55042 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRADP55042 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRADP55042 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRADP55042 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRADP55042 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRADP55042 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRADP55042 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRADP55042 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRADP55042 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRADP55042 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRADP55042 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRADP55042 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RRADP55042 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRADP55042 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRADP55042 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRADP55042 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRADP55042 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRADP55042 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRADP55042 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRADP55042 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRADP55042 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRADP55042 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRADP55042 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRADP55042 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRADP55042 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRADP55042 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRADP55042 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRADP55042 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRADP55042 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRADP55042 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRADP55042 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRADP55042 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RRADP55042 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRADP55042 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRADP55042 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRADP55042 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRADP55042 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRADP55042 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRADP55042 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRADP55042 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRADP55042 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRADP55042 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRADP55042 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRADP55042 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RRADP55042 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms